Bien antes que nada, me encargue tanto en el anime como en el manga, de ver en diferentes fansubs, lo que Kabuto le decía a Tobi, sobre la manera en que este le llamaba Madara Uchiha


Como ustedes lo pudieron comprobar, no se sabe a ciencia cierta que dijo exactamente Kabuto, entonces para eso hice este análisis:
Dialogo sacado de esta página: https://forum.onemanga.com/showpost.php?p=3577980&postcount=12

Y esta imagen:

Kabuto como lo mostré en las viñetas dijo exactamente esto, en japonés:
カブト『物分かりのいい方ださすがはうちはマダラ…器が違う』
No se japonés (si alguien lo sabe le agradecería un mejor análisis), pero intentare, por medio de traducción, analizar cada parte.
うちはマダラ: Esto significa Madara Uchiha, https://es.naruto.wikia.com/wiki/Madara
カブト: Esto es Kabuto, ósea que él dijo esto, https://es.naruto.wikia.com/wiki/Kabuto
]物分かりのいい方だ: Textualmente es “Sé que es una buena cosa”, debe referirse a algo bueno, o que está bien.
さすがは: esto dice “Es verdaderamente” debe referirse a algo que es cierto algo no refutable.
]物分かりのいい方ださすがは: Uniendo las dos primeras frases textualmente dice “En verdad comprendo cómo las cosas buenas” debe referirse que el ya comprende algo, que está seguro de eso.
器が違う: Esta es la frase más importante que dice todo, lo cual requiere un análisis más profundo, ya que textualmente todo dice: “Lo diferentes instrumentos”.
器: Este es un Kanji que significa, Vasija, recipiente, utensilio, herramienta, implemento.
が:La.
違: Diferencias.
う: Vendido.
(Información sacada por traducción, y por esta página https://es.wikipedia.org/wiki/Jinmeiyo_kanji)
Solo me fijare en el primer y tercer Kanji, ósea, con este se pudo referir, que él es Madara, que está seguro de ello, y que es bueno, pero, que está en un recipiente diferente, o es una herramienta o utensilio diferente.


Entonces, después de ese análisis, concluyo, que Tobi es Madara, solo que Tobi es otro contenedor de la conciencia de Madara, alguien que es solo el cascaron vació de Madara, que solo busca tener el poder de Madara, es por eso que él se llama Madara, o textualmente dice el poder de Uchiha Madara, Tobi debió ser la manera en que Madara, trato de hacer funcionar las células de Hashirama, en él.
Por eso, dije mi teoria sobre que, Tobi es Madara

Como podemos ver en la imagen, el Kyubi reconoció el chacra, justo antes de que este fuera controlado, lo que significa que el chacra de Tobi, él ya lo conocía, ósea que además de a palabras de Tobi, el mismo tiene el poder de Madara, algo que no se puede negar, de paso Tobi tiene también el poder Hashirama, junto al rinnegan, y busca también el poder de Rikudo, de todo esto derivo que para que el tuviera ese chacra, pudo ser alguien que hizo lo mismo que Kabuto pero con Madara, pero la verdad yo creo que Tobi, es tan solo una representación de un cascaron vacío de Madara Uchiha, dando que este también es Madara.

Desde antes Tobi concigio ese poder pero hace 16 años, aun no estaba completamente dado en su cuerpo

En esta imagen, se puede notar el ADN de Hashirama que apenas está asimilando, cosa que leugo se ve más completa en su cuerpo

El hecho de que Tobi tenga ese poder, me hace pensar que fue la manera que Madara intento para asimilar o experimentar ese poder, ya que como vemos, con Orchimaru, muchos niños morían; no es fácil tenerlo, al final Tobi como también tenía los mismo ideales de Madara, tuvieron el mismo plan, y de seguro Madara como necesitaba tiempo y quería logra el plan ojo de la luna, entonces dejo su conciencia y poder en Tobi, el cual procigaría

Ya ha salido madara, puede que sea Obito o puede que sea quien menos te lo esperas, no quedaría muy bien que después de todo fuera otra vez Madara. Además Kabuto invoca Madara y se refiere a el como alguien muerto.

Tal como Rikudo uso izanagi para crear a los bijus en base a ese chacra, Madara para completar el plan ojo de la luna, uso izanagi para crear a Tobi un cascaron de si mismo(Murio acto seguido), para asi poder estar vivo mucho mas tiempo y lograr el plan, para luego revivirse, ya que tomaria muchos años